Debutta nel 1990 insieme agli Afterhours con l'album d'esordio During Christine's Sleep, cui seguono nel 1992 Mio Fratello è Figlio Unico, per l'album tributo legato ad Arezzo Wave, e nel 1995 il primo album tutto in italiano, Germi.
Nel 1997 esce Hai paura del buio?, e nel frattempo affianca alla sua attività di cantante, autore, chitarrista e produttore del gruppo anche quella di produttore esterno, lavorando all'album di esordio di Cristina Donà Tregua. Tra il 1997 e il 1999 collabora con i Pitch, gli Scisma, i Massimo Volume , i La Crus.
Nel maggio 1999 esce Non è per sempre, nel 2001 Siam tre piccoli porcellin e nel 2002 Quello che non c'è; nel 2001 prende il via anche il primo Tora! Tora! Festival fortemente voluto da Manuel, di cui è tutt'oggi direttore.
Sempre grazie alla voglia di collaborare con altri musicisti, caratteristica che lo ha reso un artista unico nel panorama musicale italiano, gli Afterhours hanno realizzato nel 2004 un tour con i Twilight Singer di Greg Dulli: collaborazione che ha fruttato loro il debutto internazionale con Ballads for Little Hyenas.
Dopo un secondo tour americano, iniziato con la partecipazione al South by Southwest Festival di Austin, realizzano nel maggio 2008 I Milanesi Ammazzano il Sabato.